А в чём была причина отсутствия таких вагонов на этом маршруте?

МУП "ЗТУ" опасается за стёкла. В районе много школьников, которым нечего делать, и они тратят время на обстреливание стёкол трамваев/автобусов, а порой и Мт камнями, зимой - снежками иль ледышками. Был случай обстрела вагона пневматикой. Был случай обстрела мелкими камнями прямо с остановки в пристутствии родителей этих "детей".
А эксперимент заключается в проверке на сколько большая получается экономия после модернизации вагонов. Т.к. модернизировано всего 10 вагонов, то можно весь выпуск "тройки" сделать из них. На линии были вагоны: 1,13,21,32 (не модернизирован, но имеет ТИСУ),35,55,43,48,67 (3 - 608КМ, 3 - 619КТ/А и 3 - 605).
Правда не могу не сообщить, что уже после окончания эксперимента по 3 маршруту один день ходил один 619 - 41, но скорее всего лишь взамен 14, который был отбуксирован из-за поломки в депо.

Крыша такая черная от графитовых ставок?

Да