The main specialty of the San Diego trolley is operation of passenger trams alongside or on the same track with the freight railroad operation. This condition was at the core of the agreement when the trolley system was initially built, using railway right-of-way outside of the city center. Freight trains operate via tramway tracks via at least three different lines on the system. The Blue line to San Ysidro to the Mexican border (pictured) gets the most freight traffic on regular basis, with a few freight trains operating daily.

Основной особенностью трамвая Сан-Диего является движение пассажирских трамваев по коридорам железной дороги, включая общие пути с грузовыми железнодорожными поездами. Это было основой договора на момент строительства трамвайной сети в своё время с использованием ж.д. коридоров за пределами центра города. Грузовые поезда курсируют по трамвайным путям как минимум по трем различным линиям трамвайной сети. По Синей линии на San Ysidro к мексиканской границе (на фото) регулярно осуществляется наибольшее количество грузовых перевозок, до нескольких грузовых составов в день.