Вопрос к местным или знающим. Какой текст примечания в таких случаях пишется?

Михаил, в каких таких случаях? ))

Вагон едет в депо - об этом говорит инверсия цветов на ЭМУ. Конкретно интересовало, писать ли просто "Следует в депо" или ранее уже использовалась какая-то определённая формулировка (по аналогии с manipulační jízda у автобусов).

Определенной формулировки нет. В отличии от автобусов, у трамваев затяг в депо (и выезд из депо) проходит с транспортом пассажиров. На бумажных указателях бывает фраза "Vůz jede do vozovny [...]" или "Vůz končí v zastávce [...]", на электронных только "Vozovna [...]" в инверсии. Инверсия номера должна обращать внимание на измененную трассу (вагон не доедет до регулярной конечной), но к сожалению, часто инвертируют так же если депо находится в продлении трассы после регулярной конечной.