Всё-таки, не могу понять, если Ем-501 выпускались как промежуточные вагоны, то зачем им кабина? Да и фары у них предусмотрены. Возможно, в них просто не устанавливалась часть какого-то оборудования, но при необходимости их можно было дооборудовать до головных?

Да, именно так. Причём этим практически никогда и не пользовались в итоге.

Скорее всего дело в какой-нить унификации производства. Типа клепаются одинаковые кузова, но до полноценных головных дооборудуются не все.